Ngày 10/12/1978 trong khi đang làm nhiệm vụ đồng chí đã anh dũng hy sinh tại chiến trường Biên Giới Tây Nam, Thi hài được đồng đội chôn cất tại nghĩa trang Liệt sỹ Thị xã An Khê - tỉnh Gia Lai. Sự hy sinh của đồng chí đã góp phần làm rạng rỡ thêm truyền thống tốt đẹp của Quân đội nhân dân Việt Nam, làm vẻ vang truyền thống đấu tranh cách mạng của dân tộc trong sự nghiệp đấu tranh giải phóng dân tộc thống nhất đất nước.

Đến nay, sau hơn 41 năm an nghỉ tại Nghĩa trang Liệt sỹ Thị xã An Khê - tỉnh Gia Lai, được sự quan tâm của Đảng và Nhà nước, hài cốt liệt sỹ Lê Văn Yến  đã được đưa về quê hương an táng. Lễ đón nhận và an táng hài cốt liệt sỹ được tổ chức tại gia đình bà Bùi Thị Ga vợ của Liệt sĩ trong không khí trang nghiêm, xúc động. Ngay sau buổi lễ, hài cốt Liệt sỹ Lê Văn Yến được đưa về an táng tại Nghĩa trang Liệt sĩ huyện Triệu Sơn trong niềm tiếc thương vô hạn và biết ơn của đồng đội, cấp ủy, chính quyền, nhân dân địa phương và gia đình, dòng họ trước công lao to lớn và sự hy sinh anh dũng của liệt sỹ đối với sự nghiệp đấu tranh bảo vệ Tổ quốc.